Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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