Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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