Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMC1AQ14683 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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