Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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