Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms