Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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