Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PWP1Q13610 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PWP1Q13610 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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