Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2839 ms