Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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