Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms