Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms