Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTBQ06643 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBQ06643 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBQ06643 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBQ06643 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBQ06643 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms