Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms