Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN1Q04323 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms