Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAP2Q03519 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms