Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms