Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHDQ02161 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHDQ02161 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHDQ02161 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms