Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX1P78414 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRX1P78414 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRX1P78414 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRX1P78414 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRX1P78414 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX1P78414 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms