Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms