Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPD52P55327 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPD52P55327 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPD52P55327 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPD52P55327 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPD52P55327 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPD52P55327 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPD52P55327 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPD52P55327 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPD52P55327 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms