Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH15P55291 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH15P55291 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH15P55291 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH15P55291 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH15P55291 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH15P55291 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH15P55291 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH15P55291 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH15P55291 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH15P55291 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH15P55291 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH15P55291 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH15P55291 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH15P55291 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH15P55291 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH15P55291 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH15P55291 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH15P55291 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH15P55291 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH15P55291 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH15P55291 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH15P55291 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH15P55291 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH15P55291 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH15P55291 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH15P55291 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms