Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HADHBP55084 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HADHBP55084 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HADHBP55084 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HADHBP55084 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HADHBP55084 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HADHBP55084 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HADHBP55084 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HADHBP55084 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HADHBP55084 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HADHBP55084 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HADHBP55084 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HADHBP55084 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HADHBP55084 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HADHBP55084 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms