Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms