Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRKAA2P54646 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms