Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVDP53602 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms