Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms