Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTAP49354 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTAP49354 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTAP49354 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTAP49354 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTAP49354 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTAP49354 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTAP49354 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTAP49354 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTAP49354 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTAP49354 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms