Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA4P43681 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA4P43681 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms