Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP8P40818 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP8P40818 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP8P40818 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP8P40818 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP8P40818 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP8P40818 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP8P40818 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP8P40818 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP8P40818 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP8P40818 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP8P40818 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP8P40818 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP8P40818 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP8P40818 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP8P40818 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP8P40818 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP8P40818 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms