Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM23P36406 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms