Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPDP35247 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms