Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEX2P28328 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PEX2P28328 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX2P28328 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PEX2P28328 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms