Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms