Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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