Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALB2P22676 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALB2P22676 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CALB2P22676 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CALB2P22676 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CALB2P22676 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CALB2P22676 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CALB2P22676 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms