Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms