Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMY2BP19961 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms