Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBTFP17480 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBTFP17480 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBTFP17480 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBTFP17480 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBTFP17480 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBTFP17480 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBTFP17480 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBTFP17480 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBTFP17480 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBTFP17480 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBTFP17480 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBTFP17480 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBTFP17480 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBTFP17480 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBTFP17480 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
UBTFP17480 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBTFP17480 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBTFP17480 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBTFP17480 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBTFP17480 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBTFP17480 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBTFP17480 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UBTFP17480 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBTFP17480 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBTFP17480 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBTFP17480 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBTFP17480 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBTFP17480 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBTFP17480 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms