Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC172P0C7W6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms