Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGAVP06756 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms