Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF4O60810 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms