Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCAO15360 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCAO15360 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms