Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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KRTAP4-16G5E9R7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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KRTAP4-16G5E9R7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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KRTAP4-16G5E9R7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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KRTAP4-16G5E9R7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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KRTAP4-16G5E9R7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP4-16G5E9R7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP4-16G5E9R7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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