Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPA5E9PKD4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms