Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms