Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms