Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms