Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms