Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCG2Q9UNQ0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms