Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID2Q9UJV3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms